L’Université de La Rochelle recrute un Chercheur Postdoctoral EN ONCOLOGIE COMPARATIVE – RÉSISTANCE AU CANCER ET TAUX DE MUTATION SOMATIQUE en CDD de 2 ans.

Description de l’employeur

Pourquoi ne pas rejoindre une université audacieuse et innovante ?

L’Université de La Rochelle a été créée par Michel Crépeau à la suite d’une initiative volontariste des autorités locales. Depuis sa création en 1993, l’université s’est engagée sur la voie de la différenciation.

Trente ans plus tard, alors que le paysage universitaire se recompose, elle continue d’affirmer sa vision originale, fondée sur une identité forte et des projets audacieux, dans un établissement à taille humaine situé dans un cadre exceptionnel.

Internationalement reconnue pour ses programmes de recherche et d’échanges et pour la qualité de son enseignement, l’Université de La Rochelle accueille environ 1 000 étudiants étrangers de plus de 90 nationalités différentes parmi ses 8 700 étudiants. Reconnue internationalement pour ses programmes de recherche et d’échanges et pour la qualité de son enseignement, l’Université de La Rochelle accueille environ 1 000 étudiants étrangers de plus de 90 nationalités différentes parmi ses 8 700 étudiants. Reconnue internationalement pour ses programmes de recherche et d’échanges et pour la qualité de son enseignement , L’Université de La Rochelle accueille environ 1 000 étudiants étrangers de plus de 90 nationalités différentes au sein de ses 8 700 étudiants et emploie près de 1 000 collaborateurs (enseignants, enseignants-chercheurs et personnels administratifs et de soutien).

 Ancrée dans une région aux caractéristiques côtières très marquées, l’Université de La Rochelle a fait de cette singularité une véritable signature, au service d’un nouveau modèle. Ses recherches sont centrées sur la thématique des Littoraux Urbains, Durables et Intelligents (LUDI).

Site Internet à consulter : cliquez ici

Description du service

La personne recrutée rejoindra le laboratoire interdisciplinaire UMRi CNRS/LA ROCHELLE UNIVERSITE LIENSs (LIttoral ENvironnement SociétéS), regroupant environ 140 chercheurs et techniciens à La Rochelle.
Le candidat travaillera dans les équipes de recherche dirigées par Mathieu Giraudeau (UMR 7266 LIENS, Université de La Rochelle, France) travaillant sur la résistance au cancer chez les organismes sauvages et celles d’Alex Cagan (Université de Cambridge, UK) travaillant sur l’accumulation de substances somatiques. mutations.
Le poste est entièrement financé pendant 2 ans par une Chaire d’Excellence Nouvelle Aquitaine attribuée à Mathieu Giraudeau. Le post-doctorant embauché passera du temps en France et au Royaume-Uni (le temps passé dans chaque université peut être discuté).

Missions

Chaque organisme accumule des mutations dans ses cellules d’ADN en vieillissant. Si la plupart de ces mutations n’auraient aucun impact sur le fonctionnement de l’organisme, des mutations dans certaines régions génomiques peuvent transformer des cellules saines en cellules cancéreuses. Ce n’est que récemment qu’il est devenu possible d’étudier directement cette transformation de cellules saines en cellules malignes, grâce aux progrès de la précision des technologies de séquençage du génome. Ce travail révèle comment différents types de cellules accumulent des mutations à des rythmes différents (https://www.nature.com/articles/s41586-021-03822-7 ) et comment des cellules porteuses de mutations cancéreuses peuvent se propager et coloniser des tissus apparemment sains à mesure que nous vieillissons ( https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30337457 ). Même si nous en apprenons beaucoup sur le fonctionnement de ces processus chez les humains, nous ne savons pratiquement rien des autres espèces. Nous avons récemment découvert que les taux de mutation somatique varient considérablement entre les espèces de mammifères ( https://www.nature.com/articles/s41586-022-04618-z ), ce qui pourrait expliquer en partie les différences de risque de cancer observées entre les espèces ( https:/ www.nature.com/articles/s41586-021-04224-5 ). Bien que ces travaux aient permis de mieux comprendre comment les taux de mutation varient d’une espèce à l’autre, ils se sont limités à un seul type cellulaire chez 16 espèces de mammifères. Une étude plus complète des processus mutationnels chez un plus grand nombre d’espèces présentant différentes susceptibilités au cancer ferait progresser considérablement notre connaissance de la cancérogenèse chez différentes espèces.

En prélevant des échantillons de tissus sanguins à partir de collections congelées et prospectivement à partir d’autopsies, nous pouvons extraire l’ADN et effectuer un séquençage d’ADN de nouvelle génération à l’aide d’une méthode de séquençage ultra-précise ( https://www.nature.com/articles/s41586-021-03477-4 ). À l’aide de ces données, nous comparerons les processus mutationnels entre espèces et les relierons au risque de cancer, à la longévité et à d’autres traits d’histoire de vie. De plus, une analyse de signature mutationnelle sera effectuée sur ces données pour en déduire les différents processus mutationnels ayant contribué aux mutations détectées dans chaque échantillon. Étudier comment différentes espèces accumulent ces mutations somatiques à mesure qu’elles vieillissent promet de faire progresser notre compréhension des raisons pour lesquelles le risque de cancer varie d’une espèce à l’autre. Cela pourrait à terme conduire à l’identification de mécanismes par lesquels certaines espèces seraient capables de réduire leur risque de cancer. Ces travaux permettront également de mieux comprendre comment les mutations s’accumulent, un processus biologique fondamental.

En résumé, ce travail contribuera à contextualiser les données émergentes sur les processus mutationnels chez l’homme, pertinentes pour notre compréhension des cancers humains, et révélera la relation entre le taux de cancer, la durée de vie et la mutation dans l’arbre de vie.

Activités

Vos principales responsabilités comprendront :

• Comparer les processus mutationnels entre espèces et les relier au risque de cancer, à la longévité et à d’autres caractéristiques du cycle vital à l’aide de données
• Analyser la signature mutationnelle pour en déduire les différents processus mutationnels qui ont contribué aux mutations détectées dans chaque échantillon
• La liste des activités n’est pas exhaustive et pourra être discutée lors de l’entretien.

Ces activités ne sont pas exhaustives et peuvent évoluer en fonction des besoins du projet.