La correction spécifique de l’épissage de l’ARNm à l’aide de petites molécules est un domaine émergent de découverte de médicaments qui a déjà fourni des applications thérapeutiques innovantes dans le contexte de maladies héréditaires. Dans le contexte de l’amyotrophie spinale et de la maladie de Hungtington, la petite molécule agit comme une colle moléculaire entre la première particule du spliceosome et un site d’épissage 5′ bombé A _-1 pour favoriser une correction d’épissage spécifique et fournir des traitements disponibles par voie orale. Même si le mécanisme d’action des premiers modificateurs d’épissage des petites molécules a été élucidé (Campagne S. et al., Nat. Chem. Biol. 2019 ; Malard F. et al., Nucleic Acids Research 2024) et le concept de 5′- La réparation du renflement du site d’épissage a été découverte, mais il reste encore quelques questions ouvertes pour bien comprendre la sélectivité génétique des modificateurs d’épissage ciblant un site d’épissage 5′ bombé A _-1 . Notamment, afin d’être sensible à la petite molécule, l’exon doit contenir une adénine en position -1 (comme le souligne le mécanisme de réparation du renflement du site d’épissage en 5′), mais doit également contenir un élément cis-ARN riche en purines. dans l’exon, bien connu pour recruter des facteurs de trans-épissage. Afin de mieux comprendre la spécificité des modificateurs d’épissage A _-1 , le doctorant développera un protocole pour réassembler le complexe de correction d’épissage (modificateur d’épissage A _-1 , snRNP U1, facteurs de trans-épissage et un fragment synthétique de pré-ARNm) sur un fragment d’ARNm transcrit in vitro dans un extrait nucléaire HeLa commercial. Le candidat optimisera la purification du complexe de correction d’épissage afin de déterminer sa composition par spectroscopie de masse et sa structure cryoEM. Ensemble, nous visons à faire la lumière sur la structure quaternaire stabilisée par le modificateur d’épissage A _-1 afin de découvrir pleinement la sélectivité génétique du commutateur d’épissage synthétique, mais également des informations sans précédent sur la régulation de l’épissage de l’ARNm. En parallèle, le doctorant participera également au projet de groupe visant à diversifier le pool de modificateurs d’épissage de petites molécules et découvrira, à l’aide de méthodes de pointe basées sur l’IA, de nouveaux modificateurs d’épissage agissant sur U _-1 et C _-1 bombés 5. ‘-sites d’épissage. Étant donné que de nombreuses maladies proviennent de mutations se situant en position -1 des sites d’épissage 5’, l’objectif général du projet est d’explorer davantage les bases fondamentales de la spécificité du gène modificateur d’épissage des petites molécules, mais également de concevoir de manière rationnelle de nouveaux outils pour la biomédecine. . Ce projet de thèse est financé par la FRM (Fédération de la Recherche Médicale) dans le cadre du programme Amorcage et la date de démarrage prévue est le 1 ^er septembre 2024.

Catégorie de financement : Financement public/privé
Fondation de la recherche médicale
Titre du doctorat : Doctorat de biologie
PHD Pays : France