Comment la vie émerge-t-elle des molécules et des cellules ? C’est la question centrale qui nous motive. Avec curiosité et passion, nous étudions tout le spectre allant de l’atome à l’organisme. Le Biozentrum de l’Université de Bâle est l’un des principaux instituts des sciences de la vie au monde. Avec 32 groupes et 500 employés, nous sommes une communauté de recherche dynamique et internationale qui a engendré de nombreuses découvertes fondamentales en biologie et en médecine ainsi que plusieurs lauréats du prix Nobel. Devenez membre de notre communauté !

Un poste postdoctoral est disponible dans le groupe de recherche du professeur Erik van Nimwegen. Le poste est initialement d’une durée de deux ans, financé par une subvention du FNS, mais peut être prolongé d’un commun accord. Le boursier postdoctoral sera supervisé par T. Julou et E. van Nimwegen. Le poste est disponible immédiatement et la priorité sera donnée aux candidats pouvant débuter relativement prochainement.

Le sujet de ce projet concerne Escherichia coli en phase stationnaire, comme étude de cas de bactéries non en croissance. Bien que les bactéries sauvages passent probablement la majorité de leur temps dans des états de non-croissance, on sait relativement peu de choses sur la physiologie cellulaire et l’expression des gènes dans de tels états, en particulier au niveau unicellulaire. Notre laboratoire utilise de nouvelles approches quantitatives, telles que celle que nous avons récemment développée pour suivre quantitativement la croissance et l’expression des gènes avec une résolution unicellulaire chez les bactéries exposées à des changements environnementaux contrôlés [1, 2]. Nous nous intéressons aux aspects physiologiques et évolutifs de la phase stationnaire : Quels sont les différents états physiologiques pouvant être atteints pendant la phase stationnaire ? Quelle est l’étendue et la dynamique de l’hétérogénéité cellulaire en période stationnaire, et comment cette hétérogénéité affecte-t-elle la survie, la résistance au stress et la capacité des cellules à repousser lorsqu’elles sont exposées à de nouveaux nutriments ? Existe-t-il des compromis évolutifs entre les traits liés à la croissance et les traits liés à la famine ? Pour répondre à ces questions, le candidat devra combiner des techniques expérimentales de biologie moléculaire, de génétique, de vidéo-microscopie, de microfluidique et de microfabrication, avec des techniques d’analyse et de modélisation de données de pointe, qui pourront être entreprises en collaboration avec des chercheurs théoriques du laboratoire. Le projet sera adapté aux intérêts et aux compétences du candidat retenu, et profitera de plusieurs résultats récents déjà obtenus dans notre groupe.

Les candidats doivent avoir complété un doctorat dans un domaine pertinent tel que la biophysique, la biologie quantitative, la microbiologie ou l’évolution. Une expérience antérieure en microscopie et en microfluidique sera valorisée. Le candidat doit avoir une expérience démontrée en programmation pour l’analyse de données et/ou en modélisation mathématique.

Candidature / Contact

Veuillez postuler en ligne : https://biped2.biozentrum.unibas.ch/apply/postdoc-position-vannimwegenlab

La candidature doit inclure une brève lettre de motivation expliquant en quoi vos qualifications et votre expérience font de vous un bon candidat pour ce poste, ainsi qu’un CV complet et à jour et les adresses de deux références. Veuillez postuler en ligne en utilisant uniquement les champs obligatoires, ainsi que le champ pour les références et les pièces jointes (lettre de motivation et CV) – les autres champs ne seront pas pris en compte.

Nous examinerons les candidatures au fur et à mesure de leur réception jusqu’à ce que le poste soit pourvu. Veuillez noter que seules les candidatures en ligne via le portail de candidature seront acceptées. Pour des demandes générales, veuillez envoyer un e-mail à thomas.julou@unibas.ch .

Le laboratoire van Nimwegen du Biozentrum de l’Université de Bâle est une équipe internationale et multidisciplinaire possédant une vaste expertise dans le domaine de la régulation de la transcription, de la variabilité de cellule à cellule, de l’évolution du génome et des techniques d’analyse de données probabilistes. Une particularité de notre groupe est qu’il comprend à la fois des chercheurs expérimentaux et théoriques qui travaillent ensemble pour combiner des outils statistiques et informatiques de pointe avec des expériences quantitatives. Une liste des publications de notre groupe est disponible sur Google Scholar .

[1] 1. M. Kaiser, et al., Nat Commun. 9, 212 (2018). https://doi.org/10.1038/s41467-017-02505-0
[2] T. Julou, et al., PLoS Biol. 18, e3000952 (2020). https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3000952